Недавно разработанный способ проведения анализа генетических кодов SARS-CoV-2 способен привести к ускорению разработки вакцины. Это, в свою очередь, поможет разобраться в процессе развития его штаммов. С новой работой ученых из CSIRO, национального научного агентства Австралии, можно ознакомиться в материале издания Transboundary and Emerging Diseases. Отмечается, что проведение анализа информации по имеющимся последовательностям генома нового типа коронавируса является важной работой, позволяющей понять, как устроен вирус, выяснить течение болезни, а также обнаружить новые штаммы в случае их проявления, пояснили авторы работы.
При проведении новой работы исследователями была разработана новая платформа визуализации. Она основана на алгоритмах биоинформатики, которые изначально использовались для анализа генома человека. Новая платформа поможет обнаружить основные различия между тысячами генетических последовательностей вируса SARS-CoV-2 и констатировать факт возникновения новых штаммов вируса, а также сделать более упрощенным их распределение по кластерам.
«На сегодняшний день в мире существует большое количество отдельных вирусных последовательностей. Благодаря оценке расстояния между ними и их визуализации исследователи могут получить информацию о различных штаммах вируса, в том числе о том, откуда они произошли и как они развиваются», - сказал ведущий автор исследования Денис Буер.
Благодаря анализу генетических последовательностей SARS-CoV-2 при помощи нового инструмента уже удалось выяснить, какие штаммы вируса являются пригодными для тестирования вакцин, которые проводятся в Австралийском центре по обеспечению готовности к болезням в Джилонге, сказано в исследовании.
Напомним, ранее ученые из Кембриджского университета заявили, что вспышка коронавируса в Китае могла возникнуть еще в сентябре прошлого года на юге страны. К тому же, сама вспышка могла произойти не в Ухане, который считается официальным местом начала пандемии, а на юге Китая. Мутация вируса в его окончательную форму произошла перед началом пандемии за несколько месяцев до момента его регистрации. К тому же, все это время он мог пребывать в теле или летучей мыши, или человека, не передаваясь другим особям.
При проведении исследования учеными была использована филогенетическая сеть — математический алгоритм, способный картировать глобальное движение организмов через мутацию их генов.